Doxygen 是一个 C++, C, Java, Objective-C、Python、IDL (CORBA 和 Microsoft flavors)、Fortran、VHDL、PHP、C#和D语言的文档生成器。可以运行在大多数类Unix系统，以及Mac OS X操作系统和Microsoft Windows 。 初始版本的Doxygen借鉴了一些老版本DOC++的代码；随后，Doxygen源代码由Dimitri van Heesch重写。

Doxygen是一个编写软件参考文档的工具。 该文档是直接写在代码中，因此比较容易保持更新。 Doxygen 可以交叉引用文档和代码，使文件的读者可以很容易地引用实际的代码。

新版本改进记录：

• The navigation tree (GENERATE_TREEVIEW=YES) has been redesigned.
• The local search engine is now more compact, so the search data loads faster.
• Support has been added for cross-referencing smart-pointer like classes.
  
• Support for PHP heredoc has been added.
  
• The VHDL parser has been rewritten.
  
• Many bugs have been fixed